みーのぺーじ

みーが趣味でやっているPCやソフトウェアについて.Python, Javascript, Processing, Unityなど.

医療統計

Statistics review シリーズ一覧

Crit Care.にシリーズで投稿されている統計学のreview論文を見つけたのですが,論文がシリーズになっていると一覧しにくいので,リンクを貼っておきます. これだけ充実していると,統計学の教科書を買う必要がないように思います.無料で読めるのでありがた…

Pythonで生存分析

Pythonで生存分析の練習をしながら統計の理解を深めるための記事です.この記事を読めば,統計のreview論文1つとPythonを用いた統計処理が追えるようになっています. Critical Care 2004, 8:389-394に書いてあることを適宜訳しながらPythonで検証します. …

lifelinesで解析してみた

JupyterでKaplan-Meier 曲線を書いてみました. 使用したデータは German Breast Cancer Study Group 2 です. datasets — lifelines 0.24.1 documentation 項目 GBSG2 function | R Documentation horTh : hormonal therapy, a factor at two levels no and…

VS CodeでAnacondaのJupyter Labを快適に使う

Jupyterを使うには,Jupyterサーバーを立ち上げて,クライアントとしてブラウザーを使うのが標準です. これはこれでよくできているのですが,やはりVS Codeに慣れていると,いろいろと不自由なことが多いです.試しにVS Codeでipynbファイルを開いたら,Jup…

疫学研究の統計に関するunittest

最近,疫学研究の勉強をしています.疫学研究はR言語で解説されていることが多い印象ですが,Python好きのみーとしては,Pythonで統計処理したいので,Pythonで疫学研究を行うことにしました. 代表的な統計計算をPythonで行えるかをUnittestにしました.問…