Unity 4では、iOSにおける、GUI.Labelなどで使用するフォントの大きさが簡単に設定できるようになったようです。
以下のGUIStyleの設定画面にて、フォントサイズを設定するだけです。Androidは実機持っていないので分かりませんが、おそらく同様の設定でうまく動くような気がします。あまりにも簡単ですが、忘れそうなのでここにメモしておきます。
http://docs-jp.unity3d.com/Documentation/Components/class-GuiText.html
